J'ai trouvé la réponse suivante dans le vadémécum (2016): c'est donc la valeur comptable.
"Le matériel donné au titre de la TA par l’entreprise est soit un bien acquis à titre onéreux soit un bien
produit par elle. Le matériel concerné relève soit des comptes de stocks et en-cours soit des comptes
d'immobilisations corporelles de l'entreprise. La valeur retenue pour un matériel relevant des stocks et
en-cours est la valeur d'inventaire ou valeur actuelle.
La valeur retenue pour un matériel relevant des
immobilisations corporelles est la valeur comptable résiduelle. L'entreprise attribuant une subvention
sous forme de matériels adresse au chef d'établissement bénéficiaire les pièces et extraits de documents
comptables justifiant de la valeur des matériels livrés. Cette transmission précise les coordonnées de
l'organisme collecteur retenu par l'entreprise. Le chef d'établissement établit un reçu destiné à
l'entreprise daté du jour de la livraison des matériels qui indique la valeur comptable dûment justifiée
par l'entreprise."
Pour les CFA, il est en effet inscrit sur le site de l'urssaf que:
"Les entreprises peuvent bénéficier, pour leurs établissements en France ou de l’Outre-mer, de deux déductions au solde de la taxe d’apprentissage :
- la déduction correspondant aux subventions versées en nature aux CFA sous forme d’équipements et de matériels conformes aux besoins des formations dispensés (article L6241-4 du code du travail);
Faut-il alors comprendre que seuls les CFA peuvent avoir de la TA en nature?