Chez moi, on récupère les absences pour rendez-vous médical (parce qu'il est des tas de circonstances où l'on va consulter sans pour autant être malade). Si maladie il y a, le médecin délivre un certificat en ce sens.
Dans le cas d'espèce, il faut voir si la reconnaissance travailleur handicapé s'accompagne d'un aménagement horaire du poste pour permettre à l'intéresse de se rendre à des RDV précis liés à sa pathologie. C'est à la CT de le dire... Si rien n'est prévu à l'heure actuelle, il faut peut-être conseiller à l'agent de faire une demande en ce sens auprès de son employeur.