Je ne suis pas certaine que vous soyez sur le meilleur forum pour répondre à ce genre de questions car il s'agit du forum des intendants de collège et de lycée.
Ceci dit, le lien suivant semblerait prouver que le fait de passer à temps partiel facilite le cumul avec le statut d'auto-entrepreneur car il n'y a plus besoin de l'autorisation de la hiérarchie: http://www.planete-auto-entrepreneur.com/autoentrepreneur/fonctionnaires-et-auto-entrepreneur--3-cas-de-cumul-autorises.html
Sauf que, si j'ai tout compris, ce n'est plus auto-entrepreneur que vous souhaitez être, auquel cas vous retombez sous le régime classique des demandes de cumul et cette question/réponse vous intéresse: http://www.senat.fr/questions/base/2010/qSEQ100111663.html
Mais, à votre place, j'irais chercher d'autres réponses à un endroit plus approprié.
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Marquise de la Zone
Grande Dauphine