Bonsoir,
Premièrement, il ne s'agit pas d'heures supplémentaires, mais d'heures complémentaires.
Deuxièmement, il existe bien une exonération des cotisations patronales de 1,50 € à compter du 1er septembre 2012... Il n'y a plus d'exonération pour les cotisations salariales (pour plus de précisions, voir ici). Il peut y avoir une majoration de 10 % et 25 % des heures complémentaires. Le SMIC s'applique bien à tous les travailleurs français ou étrangers.
Troisièmement, la possibilité d'effectuer des heures complémentaires doit être prévue dans le contrat de travail à temps partiel...
Quatrièmement, les bénéficiaires d'un CUI-CAE ne doivent pas effectuer d'heures complémentaires, ni d'heures supplémentaires car elles ne sont pas financées, ni exonérées (pour les exonérations de cotisations applicables, voir là). Cette exonération n'a rien à voir avec le taux horaire de la rémunération...
Vous vous trompez et votre employeur aussi.