Le fonds de roulement de l'EPLE lui appartient en propre, c'est "grosso modo" l'addition des éléments suivants :
La trésorerie + les créances - les dettes (à court terme)
Les fonds d'urgence sont des fonds dont dispose la collectivité territoriale pour les interventions d'urgence.
Quant aux "fonds de fonctionnement", je suppose qu'il s'agit de la dotation de fonctionnement, c'est à dire la subvention qui nous est accordée pour assurer l'essentiel de notre budget dit "de fonctionnement" lui aussi, mais cette expression m'est peu familière...
On ne peut prélever sur le fonds de roulement que par une DBM pour vote (n°32), c'est à dire soumise au conseil d'administration, qui ne sera exécutoire que 15 jours après réception de l'acte du CA par les autorités de tutelle.
Pour les fonds d'urgence, c'est à la CT de décider si elle les débloque ou non.