Les jours feries exemple le 11 novembre dans l'annualisation du tmps de travail est il compté comme du temps travaille

Oui si l'agent (fonction publique de l'Etat) travaille la veille ou le lendemain du jour férié.

Attention si il s'agit d'un agent de la CT, prendre l'attache de celle-ci.
En effet les règles appliquées par les CT sont propres à chacune, certaines comptent les jours fériés comme travaillés dans l'emploi du temps annuel (comme dans la FP d'état), d'autres non.

Apparemment cettre règle ne prévaut pas dans la fonction publique territoriale

Il y a surtout des Collectivités Territoriales qui ont toutes leurs propres règles (et pas seulement pour le décompte des jours fériés) !!
Il n'y a qu'à voir les débats qui ressortent régulièrement sur les temps de travail hebdomadaires de certaine CT.