Pourquoi pas, il n'existe pas de réglementation à proprement parler pour les frais des élèves. De plus, sans visa, l'élève ne pourra faire son stage.
La délibération en CA n'est pas forcément exhaustive, tout dépend comment elle a été formulée : si elle prévoit une liste limitative de frais pris en charge, il faut se limiter à cette liste ou la modifier par le biais d'un vote.
Pour un visa : une mention du style "frais annexes liés au déplacement" fera parfaitement l'affaire.
Et si cela pose problème, il reste toujours les fonds sociaux (qui peuvent aussi prendre en charge les frais de réalisation du passeport d'ailleurs).